Z BioFizInfo
(→Materiały z ćwiczeń) |
(→Materiały z wykładów) |
||
| Linia 27: | Linia 27: | ||
:Proponuję poczytać wykład pana Daniela E. Kahne dotyczący termodynamiki zwijania białek ze strony Life Sciences 1A [http://sites.fas.harvard.edu/~lsci1a/10-12notes.pdf] | :Proponuję poczytać wykład pana Daniela E. Kahne dotyczący termodynamiki zwijania białek ze strony Life Sciences 1A [http://sites.fas.harvard.edu/~lsci1a/10-12notes.pdf] | ||
:oraz publikację profesora Andrzeja Kolińskiego o modelach zredukowanych z 2007 roku [http://www.mini.pw.edu.pl/~konwersa/konspekty/wkladka_kolinski.pdf] | :oraz publikację profesora Andrzeja Kolińskiego o modelach zredukowanych z 2007 roku [http://www.mini.pw.edu.pl/~konwersa/konspekty/wkladka_kolinski.pdf] | ||
| + | |||
| + | [[Media:Wykład2_MM_MD_MC_DB.pdf | '''Wykład 4: Mechanika i dynamika molekularna, dynamika Monte Carlo, dynamika Brownowska''']] | ||
== Materiały z ćwiczeń == | == Materiały z ćwiczeń == | ||
Wersja z 10:13, 17 sty 2017
Materiały przygotowujące do wejściówki z Linuxa
- (plik do pracy dla tego skryptu to plik z ćwiczenia 2 ze skryptu vi)
Materiały z wykładów
Wykład 1: Białka - na podstawie Molecular Conceptor'a - spis zagadnień
Wykład 2: Modelowanie homologiczne
Wykład 3: Modelowanie białek ab initio / de novo
- Proponuję poczytać wykład pana Daniela E. Kahne dotyczący termodynamiki zwijania białek ze strony Life Sciences 1A [1]
- oraz publikację profesora Andrzeja Kolińskiego o modelach zredukowanych z 2007 roku [2]
Wykład 4: Mechanika i dynamika molekularna, dynamika Monte Carlo, dynamika Brownowska
Materiały z ćwiczeń
Szablon do raportu I - analiza białek
Publikacje do raportu II
Procedura przygotowania układu do dynamiki molekularnej w pakiecie NAMD/VMD